České Budějovice ist eine bedeutende Kreuzung des Straßenverkehrs, der an das Europäische Transportnetz anschließt.
E 49 Deutschland – Plzeň – České Budějovice – Österreich
E 55 Skandinavien – Tschechische Republik (Prag – České Budějovice) – Österreich – Italien bis Kreta
Straßen der 1. Klasse:
I/34 České Budějovice – Jindřichův Hradec – mit Anschluss an die Autobahn D1 (Praha – Brno)
Geplante Autobahn:
D 3 Praha – České Budějovice – Österreich
In České Budějovice ist ein zentraler Busbahnhof, durch den an Arbeitstagen im Durchschnitt 300 Busse von 24 Transportgesellschaften fahren. An Samstagen sind es etwa 80 Busse und an Sonntagen etwa 90 Busse.
Der inländische Busverkehr deckt mit dessen Buslinien (mit Umsteigmöglichkeiten) das ganze Gebiet der Tschechischen Republik ab. Es gibt 10 internationale Buslinien, die den Busbahnhof nutzen. Sie verbinden České Budějovice mit Frankreich, Italien, Österreich, der Slowakischen Republik, der Bundesrepublik Deutschland und der Ukraine.
Eine bedeutende Transportgesellschaft, die die verkehrsmäßige Erschließung im Rahmen der Budweiser Region gewährleistet, ist ČSAD JIHOTRANS a.s. České Budějovice. Diese Aktiengesellschaft betreibt insgesamt 59 Linien innerhalb der Region, 3 Fernlinien (Direktlinie nach Prag und über Týn nad Vltavou, Brünn) und 2 internationale Linien (Linz und Banská Bystrica). Sie verfügt über 163 Busse, davon 15 für Sonderfahrten.